Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PlnP61014 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PlnP61014 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PlnP61014 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PlnP61014 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms