Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdo1P60334 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms