Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scarf2P59222 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scarf2P59222 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms