Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bace1P56818 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Bace1P56818 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bace1P56818 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms