Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lim2P56563 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms