Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gp1bbP56400 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms