Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp1P56183 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms