Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ephb3P54754 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ephb3P54754 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms