Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CnbpP53996 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms