Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fgd1P52734 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fgd1P52734 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms