Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ApodP51910 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ApodP51910 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ApodP51910 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ApodP51910 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ApodP51910 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms