Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MipP51180 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MipP51180 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MipP51180 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MipP51180 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MipP51180 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MipP51180 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MipP51180 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MipP51180 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MipP51180 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms