Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnnt2P50752 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms