Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa-rs12P50716 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms