Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx3P50481 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms