Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BckdhaP50136 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BckdhaP50136 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms