Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmod1P49813 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms