Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Epb41P48193 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms