Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl5P47962 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl5P47962 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl5P47962 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl5P47962 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms