Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic1P46684 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms