Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf1P46099 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms