Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf4P43488 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf4P43488 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms