Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ItgavP43406 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms