Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl28P41105 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl28P41105 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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