Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cap1P40124 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms