Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms