Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf1P39428 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms