Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik2P39087 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms