Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TtlP38585 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TtlP38585 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TtlP38585 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtlP38585 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtlP38585 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtlP38585 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtlP38585 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TtlP38585 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TtlP38585 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TtlP38585 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms