Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sar1aP36536 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sar1aP36536 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms