Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn1P35821 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms