Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sftpa1P35242 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sftpa1P35242 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sftpa1P35242 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sftpa1P35242 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sftpa1P35242 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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