Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc5P32043 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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