Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch4P31695 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Notch4P31695 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Notch4P31695 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Notch4P31695 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Notch4P31695 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Notch4P31695 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms