Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc11P31313 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc11P31313 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms