Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msr1P30204 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms