Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vcam1P29533 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms