Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NapbP28663 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NapbP28663 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NapbP28663 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NapbP28663 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NapbP28663 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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