Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BgnP28653 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BgnP28653 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BgnP28653 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BgnP28653 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BgnP28653 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms