Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms