Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CftrP26361 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CftrP26361 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CftrP26361 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CftrP26361 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CftrP26361 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CftrP26361 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CftrP26361 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CftrP26361 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms