Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tap1P21958 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tap1P21958 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tap1P21958 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms