Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VimP20152 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VimP20152 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VimP20152 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VimP20152 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms