Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfaP20033 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms