Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P18533 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P18533 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18533 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18533 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18533 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18533 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18533 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18533 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18533 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18533 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms