Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18527 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18527 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18527 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18527 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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