Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata1P17679 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gata1P17679 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms