Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa-rs2P17534 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa-rs2P17534 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms