Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ass1P16460 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ass1P16460 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms