Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp53P15975 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp53P15975 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms